摘要: 目的 基于專利數(shù)據(jù)挖掘與轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,探索中藥復(fù)方治療肌萎縮側(cè)索硬化癥(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)的配伍規(guī)律及精準(zhǔn)治療策略。方法 從中國(guó)專利數(shù)據(jù)庫(kù)篩選ALS中藥復(fù)方專利,通過頻次統(tǒng)計(jì)與關(guān)聯(lián)分析挖掘核心藥物及配伍規(guī)律;利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)和中藥高通量實(shí)驗(yàn)和參考數(shù)據(jù)庫(kù)(a high-throughput experiment and reference-guided database of TCM,HERB)構(gòu)建復(fù)方-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),通過模塊劃分識(shí)別核心靶點(diǎn)模塊;基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,采用非負(fù)矩陣分解(non-negative matrix factorization,NMF)對(duì)ALS患者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分型;運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)相似性分析(Vertex/Edge Overlap,VEO算法)篩選各亞組優(yōu)勢(shì)復(fù)方,結(jié)合重啟隨機(jī)游走(random walk with restart,RWR)和SymMap平臺(tái)預(yù)測(cè)證候特征。結(jié)果 通過對(duì)中國(guó)專利數(shù)據(jù)庫(kù)中11項(xiàng)治療ALS的中藥復(fù)方專利(含101味中藥)進(jìn)行配伍規(guī)律分析,發(fā)現(xiàn)黃芪、茯苓、人參、淫羊藿和當(dāng)歸為高頻核心藥物。關(guān)聯(lián)規(guī)則分析進(jìn)一步揭示關(guān)鍵藥對(duì)組合,其中白術(shù)-淫羊藿、白術(shù)-茯苓的配伍關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)。基于GSE16989數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄組NMF分析,ALS患者被劃分為4個(gè)亞組:組1顯著富集白細(xì)胞介素-17(interleukin 17,IL-17)信號(hào)通路;組2未富集顯著通路;組3與組4共同富集病毒-細(xì)胞因子互作通路。通過VEO算法計(jì)算復(fù)方蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)與各亞組的相似性,篩選出亞組特異性優(yōu)勢(shì)復(fù)方:復(fù)方11匹配組1;復(fù)方9匹配組2;復(fù)方8匹配組3、4。RWR算法結(jié)合SymMap平臺(tái)進(jìn)行亞組證候分型。結(jié)論 研究揭示了ALS的潛在優(yōu)勢(shì)中藥復(fù)方,將轉(zhuǎn)錄組亞型與中醫(yī)證候關(guān)聯(lián),為ALS“病證結(jié)合”精準(zhǔn)治療提供科學(xué)依據(jù)。
摘要: 目的 通過CiteSpace軟件對(duì)川芎Chuanxiong Rhizoma相關(guān)研究文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析,系統(tǒng)梳理近年研究動(dòng)態(tài),挖掘研究熱點(diǎn)及未來趨勢(shì),為川芎的深度研究與應(yīng)用提供參考。方法 以“川芎”為核心關(guān)鍵詞,系統(tǒng)檢索中國(guó)知網(wǎng)、萬方、維普及Web of Science(WOS)數(shù)據(jù)庫(kù)。利用NoteExpress軟件對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行去重與篩選?;诤Y選后的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)集,運(yùn)用Excel和CiteSpace工具,從年度發(fā)文量及國(guó)家分布、核心研究機(jī)構(gòu)、高產(chǎn)作者群體、高頻關(guān)鍵詞及其聚類等維度,對(duì)國(guó)內(nèi)外川芎研究態(tài)勢(shì)進(jìn)行可視化呈現(xiàn)與計(jì)量分析。結(jié)果 篩選后共納入8 809篇中文文獻(xiàn),1 076篇英文文獻(xiàn);其中,年發(fā)文量呈先增后減的趨勢(shì),發(fā)文量最多的國(guó)家是中國(guó),發(fā)文量最多的作者是王萬鐵、Peng Cheng(彭成),作者合作網(wǎng)絡(luò)顯示團(tuán)隊(duì)內(nèi)部合作較多,團(tuán)隊(duì)間合作不足;研究機(jī)構(gòu)中以南京中醫(yī)藥大學(xué)和Chengdu University of Traditional Chinese Medicine(成都中醫(yī)藥大學(xué))的發(fā)文量最多,核心機(jī)構(gòu)來自中醫(yī)藥類的高校與附屬醫(yī)院;關(guān)鍵詞分析顯示中文文獻(xiàn)的研究熱點(diǎn)主要為化學(xué)成分分析、數(shù)據(jù)挖掘、臨床研究等方面,英文文獻(xiàn)更偏向于藥理作用、分子機(jī)制等方面。結(jié)論 川芎在中醫(yī)藥領(lǐng)域的研究熱度持續(xù)?,F(xiàn)階段,川芎在冠心病、缺血性腦卒中、偏頭痛等疾病中的臨床應(yīng)用價(jià)值挖掘及基于數(shù)據(jù)的規(guī)律探索構(gòu)成研究熱點(diǎn)。未來研究應(yīng)積極融合多種現(xiàn)代技術(shù)手段,深度挖掘川芎的應(yīng)用潛力,拓展其臨床適應(yīng)證范圍,推動(dòng)其向多元化應(yīng)用方向發(fā)展,從而為該領(lǐng)域開辟新的研究路徑。
摘要: 山銀花Lonicerae Flos作為一種常用的藥食兩用中藥,具有清熱解毒、疏散風(fēng)熱的功效,廣泛應(yīng)用于中成藥、食品和保健品。近年來,市場(chǎng)需求的增加使山銀花的成分、藥效和質(zhì)量成為研究焦點(diǎn)。山銀花的質(zhì)量受到基原、產(chǎn)地、批次和加工方式等多種因素的影響,其化學(xué)成分復(fù)雜、不穩(wěn)定,給質(zhì)量控制帶來嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。通過系統(tǒng)梳理中國(guó)知網(wǎng)(China national knowledge infrastructure,CNKI)與Web of Science(WOS)中山銀花的基原、成分、生物效應(yīng)質(zhì)量評(píng)控相關(guān)文獻(xiàn),明確山銀花的變異成分、活性成分,并通過計(jì)算變異系數(shù)(coefficient of variation,CV)預(yù)測(cè)山銀花可能的I類質(zhì)控指標(biāo)。通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù),將預(yù)測(cè)的I類質(zhì)控指標(biāo)與清熱解毒功效相關(guān)聯(lián)。以綠原酸為例,分析了I類質(zhì)控指標(biāo)在山銀花的“基原鑒別-生產(chǎn)過程監(jiān)控-制劑藥效保障”全產(chǎn)業(yè)鏈的參與方式,為后續(xù)山銀花在生產(chǎn)加工以及制劑過程中關(guān)鍵監(jiān)控成分提供參考,也為其質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)優(yōu)化提供理論依據(jù)。