摘要: 目的 基于專利數(shù)據(jù)挖掘與轉(zhuǎn)錄組學分析,探索中藥復方治療肌萎縮側(cè)索硬化癥(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)的配伍規(guī)律及精準治療策略。方法 從中國專利數(shù)據(jù)庫篩選ALS中藥復方專利,通過頻次統(tǒng)計與關(guān)聯(lián)分析挖掘核心藥物及配伍規(guī)律;利用中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)和中藥高通量實驗和參考數(shù)據(jù)庫(a high-throughput experiment and reference-guided database of TCM,HERB)構(gòu)建復方-靶點網(wǎng)絡,通過模塊劃分識別核心靶點模塊;基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,采用非負矩陣分解(non-negative matrix factorization,NMF)對ALS患者進行轉(zhuǎn)錄組分型;運用網(wǎng)絡相似性分析(Vertex/Edge Overlap,VEO算法)篩選各亞組優(yōu)勢復方,結(jié)合重啟隨機游走(random walk with restart,RWR)和SymMap平臺預測證候特征。結(jié)果 通過對中國專利數(shù)據(jù)庫中11項治療ALS的中藥復方專利(含101味中藥)進行配伍規(guī)律分析,發(fā)現(xiàn)黃芪、茯苓、人參、淫羊藿和當歸為高頻核心藥物。關(guān)聯(lián)規(guī)則分析進一步揭示關(guān)鍵藥對組合,其中白術(shù)-淫羊藿、白術(shù)-茯苓的配伍關(guān)聯(lián)性最強?;贕SE16989數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄組NMF分析,ALS患者被劃分為4個亞組:組1顯著富集白細胞介素-17(interleukin 17,IL-17)信號通路;組2未富集顯著通路;組3與組4共同富集病毒-細胞因子互作通路。通過VEO算法計算復方蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡與各亞組的相似性,篩選出亞組特異性優(yōu)勢復方:復方11匹配組1;復方9匹配組2;復方8匹配組3、4。RWR算法結(jié)合SymMap平臺進行亞組證候分型。結(jié)論 研究揭示了ALS的潛在優(yōu)勢中藥復方,將轉(zhuǎn)錄組亞型與中醫(yī)證候關(guān)聯(lián),為ALS“病證結(jié)合”精準治療提供科學依據(jù)。
摘要: 目的 通過CiteSpace軟件對川芎Chuanxiong Rhizoma相關(guān)研究文獻進行可視化分析,系統(tǒng)梳理近年研究動態(tài),挖掘研究熱點及未來趨勢,為川芎的深度研究與應用提供參考。方法 以“川芎”為核心關(guān)鍵詞,系統(tǒng)檢索中國知網(wǎng)、萬方、維普及Web of Science(WOS)數(shù)據(jù)庫。利用NoteExpress軟件對檢索結(jié)果進行去重與篩選?;诤Y選后的文獻數(shù)據(jù)集,運用Excel和CiteSpace工具,從年度發(fā)文量及國家分布、核心研究機構(gòu)、高產(chǎn)作者群體、高頻關(guān)鍵詞及其聚類等維度,對國內(nèi)外川芎研究態(tài)勢進行可視化呈現(xiàn)與計量分析。結(jié)果 篩選后共納入8 809篇中文文獻,1 076篇英文文獻;其中,年發(fā)文量呈先增后減的趨勢,發(fā)文量最多的國家是中國,發(fā)文量最多的作者是王萬鐵、Peng Cheng(彭成),作者合作網(wǎng)絡顯示團隊內(nèi)部合作較多,團隊間合作不足;研究機構(gòu)中以南京中醫(yī)藥大學和Chengdu University of Traditional Chinese Medicine(成都中醫(yī)藥大學)的發(fā)文量最多,核心機構(gòu)來自中醫(yī)藥類的高校與附屬醫(yī)院;關(guān)鍵詞分析顯示中文文獻的研究熱點主要為化學成分分析、數(shù)據(jù)挖掘、臨床研究等方面,英文文獻更偏向于藥理作用、分子機制等方面。結(jié)論 川芎在中醫(yī)藥領(lǐng)域的研究熱度持續(xù)。現(xiàn)階段,川芎在冠心病、缺血性腦卒中、偏頭痛等疾病中的臨床應用價值挖掘及基于數(shù)據(jù)的規(guī)律探索構(gòu)成研究熱點。未來研究應積極融合多種現(xiàn)代技術(shù)手段,深度挖掘川芎的應用潛力,拓展其臨床適應證范圍,推動其向多元化應用方向發(fā)展,從而為該領(lǐng)域開辟新的研究路徑。
摘要: 山銀花Lonicerae Flos作為一種常用的藥食兩用中藥,具有清熱解毒、疏散風熱的功效,廣泛應用于中成藥、食品和保健品。近年來,市場需求的增加使山銀花的成分、藥效和質(zhì)量成為研究焦點。山銀花的質(zhì)量受到基原、產(chǎn)地、批次和加工方式等多種因素的影響,其化學成分復雜、不穩(wěn)定,給質(zhì)量控制帶來嚴峻挑戰(zhàn)。通過系統(tǒng)梳理中國知網(wǎng)(China national knowledge infrastructure,CNKI)與Web of Science(WOS)中山銀花的基原、成分、生物效應質(zhì)量評控相關(guān)文獻,明確山銀花的變異成分、活性成分,并通過計算變異系數(shù)(coefficient of variation,CV)預測山銀花可能的I類質(zhì)控指標。通過網(wǎng)絡藥理學和分子對接技術(shù),將預測的I類質(zhì)控指標與清熱解毒功效相關(guān)聯(lián)。以綠原酸為例,分析了I類質(zhì)控指標在山銀花的“基原鑒別-生產(chǎn)過程監(jiān)控-制劑藥效保障”全產(chǎn)業(yè)鏈的參與方式,為后續(xù)山銀花在生產(chǎn)加工以及制劑過程中關(guān)鍵監(jiān)控成分提供參考,也為其質(zhì)量標準優(yōu)化提供理論依據(jù)。